建筑外观仿良渚文化玉琮，具有鲜明的造型特点。进入博物馆，宽敞的大厅，精美的装饰，把你带入历史的空间。
馆内设7个展厅，4个单元展览。第一单元“我们的家园——余杭历史文化展”，重点反映自7000多年前马家浜文化开始至现代余杭历史发展的重大事件和各地名胜、自然资源等；第二单元“文明曙光——馆藏良渚文化精品陈列”，展示良渚遗址出土的各种精美玉器，以及黑陶器和石器；第三单元“江南水乡文化展览”，主要介绍江南水乡的形成和发展、地理景观特征、对文化形成的意义及在中国文明史中的地位；第四单元为临时展厅。
该博物馆的陈列布展工程分别被评为2003杭州市和浙江省年度优秀建筑装饰工程奖，并被推荐申报全国优秀建筑装饰工程。
该馆首次以中国文化地理区为单位设馆和组织展览，是一座既反映余杭历史，又以闻名于世的良渚文化为切入点展示中国江南水乡文化和民俗风情的博物馆。
交通位于余杭区南苑街道人民广场北侧
